ＡｌｐｈａＦｏｌｄ３の全貌とそのオープンソースの影響とは？

野崎翔平 Shohei Nosaki
@NosakiShohei

RTX5090でColabFoldがちゃんと動いて、ひと安心。AlphaFold3は動くのかしら

（出典 @NosakiShohei）

Masakazu Sekijima
@m_sekijima

ChimeraXはAlphaFold 3に触発されたオープンソースでMITライセンスの立体構造予測手法Boltz-1でタンパク質・核酸・リガンドなどの原子構造を予測可能。ChimeraX内のGUIやboltzコマンドで実行可能に。 x.com/UCSFChimeraX/s…

（出典 @m_sekijima）

佐原伸
@SlA74R852a28piP

返信先:@yaskaz よく分からんけど、凄そうですね😋 chem-station.com/blog/2024/05/a… AlphaFold3の登場！！再びブレイクスルーとなりうるのか～実際にβ版を使用してみた～ | Chem-Station (ケムステ)

（出典 @SlA74R852a28piP）

猫教授
@yaskaz

今日の講義のハイライトはやっぱ スパコンのセットアップを待ちながら一応ワーストケースシナリオに備えて手作業でちまちまみんなで分担してAlphaFold3かけてたら、セットアップできる前に12,000本かけ終わっちまったのってなんかウチのラボ凄くね？ のスライドでしたよね

（出典 @yaskaz）

フィルジェン株式会社
@Filgen_Inc

【Webセミナー】 Neurosnap Platformに搭載されたAlphaFold3クローン「Boltz-1x」を使い、タンパク質-DNA複合体の構造予測と評価の手法を解説します。ウェットラボの研究者でもすぐ使える最新ツールです。 参加登録 surveys.benchmarkemail.com/Survey/Start?i… 製品ページ filgen.jp/Product/BioSci… #フィルジェン pic.x.com/SP7rpdGx0c

（出典 @Filgen_Inc）

株式会社セツロテック【公式】
@setsurotech

AlphaFold3での構造予測をもとにFanzorヌクレアーゼとωRNAを改良し、ゲノム編集効率を大幅に改善。マウス胚へのインジェクションによるゲノム編集や、疾患モデルマウスへのAAVベクター単回投与によるin vivoゲノム編集にも成功した。Nature Chemical Biology誌。 nature.com/articles/s4158…

（出典 @setsurotech）

Yoshitaka Moriwaki
@Ag_smith

AlphaFold3は今Blackwell GPU（RTX5090 系）では動作報告がないみたいなのかな github.com/google-deepmin… 解決に向けてがんばっているようなんだけど

（出典 @Ag_smith）

Masakazu Sekijima
@m_sekijima

RareFoldは非標準アミノ酸を含むタンパク質の構造予測と設計を可能にする新モデル。AlphaFold3より高速かつ高精度で、実験でも高親和性バインダーを設計・検証。次世代ペプチド創薬に道を開く？！ x.com/BiologyAIDaily…

（出典 @m_sekijima）

ゆう
@yurinkyun03

【今日のAI速報🔥(5/23)】 Google DeepMind、新AI研究「AlphaFold 3」を発表 DeepMindはタンパク質構造予測AI「AlphaFold」の最新版を発表。今回の「AlphaFold 3」はRNAやDNA、化合物の相互作用を予測でき、創薬・バイオ研究に革命的な影響をもたらすとされている。 deepmind.com/blog/alphafold…

（出典 @yurinkyun03）